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PM小鼠模型構(gòu)建
更新時間:2025-06-26
訪問量:16
廠商性質(zhì):其他
一、PM小鼠模型構(gòu)建技術(shù)路線選擇
方法 | 周期 | 精度 | 適用場景 |
CRISPR-Base Editing | 2-3個月 | 單堿基 | C→T或A→G轉(zhuǎn)換(無需DSB) |
CRISPR-HDR | 3-5個月 | 任意突變 | 需設(shè)計ssODN供體 |
ES細(xì)胞同源重組 | 6-12個月 | 最高 | 復(fù)雜突變(如大片段替換+點突變) |
二、PM小鼠模型構(gòu)建CRISPR-HDR方案(當(dāng)前常用)
1. 靶點設(shè)計與工具選擇
gRNA設(shè)計:
靶向突變位點附近(距離<10 bp),使用Benchling優(yōu)化特異性。
推薦工具:
單堿基編輯:ABE8e(A→G)或BE4max(C→T)編輯器。
HDR修復(fù):高保真Cas9(如HiFi Cas9) + 化學(xué)修飾ssODN供體。
2. ssODN供體設(shè)計
5'同源臂 40-60nt
目標(biāo)突變+沉默突變*
3'同源臂 40-60nt
沉默突變:在PAM序列或gRNA靶區(qū)引入1-2 bp沉默突變(防止供體重切)。
化學(xué)修飾:3'端硫代磷酸酯化(增強穩(wěn)定性,IDT可合成)。
3. 受精卵注射
注射混合物:
Cas9 mRNA (50 ng/μL) + gRNA (25 ng/μL) + ssODN (100 ng/μL)。
胚胎處理:
注射后培養(yǎng)至囊胚期,移植至假孕母鼠。
4. 基因型鑒定
初篩PCR:擴增含突變位點的片段(引物距突變位點>50 bp)。
深度測序:
使用ICE工具分析NGS數(shù)據(jù),計算HDR效率。
敏感方法:ddPCR檢測低頻突變(<1%)。
5. 品系建立與驗證
傳代驗證:F0可能為嵌合體,需與野生型交配獲得穩(wěn)定遺傳。
功能驗證:
蛋白質(zhì)印跡(檢測突變蛋白表達)。
酶活檢測(如代謝酶突變需測活性)。
三、ES細(xì)胞打靶方案(超高精度)
1. 靶向載體構(gòu)建
同源臂設(shè)計:5'和3'臂各1.5-2 kb,中間含目標(biāo)突變。
篩選標(biāo)記:
正選擇:NeoR(后續(xù)可通過Flp刪除)。
負(fù)選擇:DTA(減少隨機整合)。
2. ES細(xì)胞篩選與驗證
陽性克隆鑒定:
長片段PCR(擴增整個重組區(qū)域)。
Sanger測序確認(rèn)突變位點。
3. 小鼠制備
通過囊胚注射獲得嵌合體,與Flp deleter小鼠交配刪除NeoR。
四、Base Editing方案(無DSB風(fēng)險)
1. 系統(tǒng)選擇
C→T突變:用BE4max + gRNA(靶向C在窗口4-8位)。
A→G突變:用ABE8e + gRNA(靶向A在窗口4-7位)。
2. 效率優(yōu)化
注射濃度:
BE4max mRNA (100 ng/μL) + gRNA (50 ng/μL)。
胚胎基因型:
需檢測旁系編輯(預(yù)測工具:BE-Hive)。
五、經(jīng)典案例解析
突變類型 | 疾病模型 | 構(gòu)建方法 |
BRAF V600E | 黑色素瘤 | CRISPR-HDR + ssODN |
TP53 R175H | Li-Fraumeni綜合征 | ES細(xì)胞同源重組 |
CFTR ΔF508 | 囊性纖維化 | Base Editing (C→T) |
六、常見問題與解決
問題 | 原因 | 解決方案 |
HDR效率低 | ssODN穩(wěn)定性不足 | 使用硫代磷酸酯修飾ssODN |
嵌合體突變丟失 | 生殖系未傳遞 | 增加F0交配數(shù)量,篩選生殖系傳遞后代 |
非預(yù)期旁系突變 | Base Editing脫靶 | 選擇高特異性gRNA,驗證全基因組脫靶 |